Chise et Shûji sont deux lycéens qui sortent ensemble depuis peu de temps. Ils s’y connaissent très mal en relations amoureuses mais, malgré tout, ils ont décidé, ensemble, qu’ils allaient s’aimer.
Mais le jour où Sapporo, leur ville, est attaquée par un raid aérien, Shû se rend compte que sa petite amie est une arme, l’arme ultime créée par l’armée.